พยางค์ทั่วไป ยกเว้นพยางค์พิเศษเช่น เสียงสะดุด 「っ」・เสียงดีด「ん」・เสียงยาว「ー」・เสียงสระตัวที่ 2ในสระซ้อน(เช่น: 「い」ในคำว่า「かい(会)」) จะเรียกว่า พยางค์อิสระ โดยมากประกอบด้วย พยัญชนะ 1 ตัวกับสระ 1 ตัว เช่น「め(目ตา)」 「て(手มือ)」 แต่บางครั้งอาจประกอบด้วยสระเพียงตัวเดียว เช่น 「い(胃กระเพาะ)」 「え(絵รูปภาพ)」
ในคำศัพท์ที่มีพยางค์อิสระเรียงกัน แต่ละพยางค์จะออกเสียงด้วยความยาวเท่า ๆ กัน แม้ว่า พยางค์นั้นจะเป็นแกนเสียง ก็ไม่มีการลงเสียงหนักหรือลากเสียงยาว เช่นคำว่า「かさ(傘 ร่ม)」 แกนเสียงอยู่ที่「か」เวลาออกเสียง「か(สูง)・さ(ต่ำ)」 แต่จะไม่ลงเสียงหนักหรือลากเสียงยาวที่「か」 หากลงเสียงหนักหรือลากเสียงยาวที่「か」 คนญี่ปุ่นจะได้ยินเป็น「カーサ」